Author Archives: monicascognamiglio

Analisi conformazionale

3. Disegnare le strutture a cavalletto corrispondenti alle proiezioni di Newman dell’esercizio 1

4. Disegnare la proiezione di Newman del conformero più stabile del 2-metilpropano.

5. Disegnare il conformero a più bassa energia che deriva dalla rotazione intorno al legame C2-C3 del butano.

6. Disegnare il conformero gauche del butano.

7. Tra i conformeri del butano, quale si trova al minimo di energia su un diagramma di energia potenziale:
a) gauche
b) eclissato
c) gauche e anti
d) anti

8. Mediante le proiezioni di Newman, rappresentare le conformazioni dell’1,2-dicloroetano corrispondenti ai minimi ed ai massimi di energia su un diagramma di energia potenziale.

9. Scrivere, in proiezione di Newman, i conformeri sfalsati ed eclissati dei seguenti composti:
a) 2-metilbutano, rispetto al legame C2-C3;
b) 2,2,3,3-tetrametilbutano, rispetto al legame C2-C3;
c) 1,2-dibromoetano;
d) 1,2-dicloro-1-fluoroetano;
e) esano, rispetto al legame C3-C4;
f) 2-cloro-3-metilpentano, rispetto al legame C2-C3;
g) 2-metilpentano, rispetto al legame C1-C2;
h) 2-metilpentano, rispetto al legame C2-C3;
i) 2-metilpentano, rispetto al legame C3-C4.

10. Disegnare il diagramma di energia potenziale per le conformazioni di I) etano, II) neopentano (=2,2-dimetilpropano) e III) 2-cloro-3-metilpentano (prendere in considerazione il legame C2-C3). Indicare anche i conformeri che corrispondono ai massimi e ai minimi di energia.

11. Scrivere le proiezioni di Newman della conformazione anti e delle due conformazioni
eclissate dell’1,2-diiodoetano. Quale delle due conformazioni eclissate ha energia maggiore?

12. Il seguente grafico mostra l’energia potenziale al variare dell’angolo diedro, guardando il legame C-C della molecola di 1-bromo-1-cloro-2-fluoroetano. Completare le proiezioni di Newman ed elencare il tipo di tensione presente in ciascuna di esse


13. Quello riportato di seguito è il diagramma delle variazioni di energia potenziale rispetto all’angolo diedro per l’1,2-dicloroetano.

a) A cosa corrispondono A, C, E, G? 
b) Disegnare le proiezioni di Newman di tutti i conformeri eclissati, indicandoli con la lettera corrispondente sul grafico                                

14. Il grafico in basso mostra le variazioni di energia che avvengono durante la rotazione del legame C-C indicato dalla freccia. Quale/i lettera/e sul grafico corrisponde (o corrispondono) alla proiezione di Newmann mostrata in basso?

Analisi conformazionale

Difficoltà a capire e visualizzare le diverse conformazioni?
Be’…è il momento giusto per utilizzare i vostri modellini molecolari. Questi possono aiutarvi tantissimo nel visualizzare la disposizione spaziale degli atomi delle molecole.
Inoltre, di seguito sono disponibili diversi video e risorse interattive (scorrete la pagina dopo i video per trovare i link a queste ultime) che possono esservi di grandissimo aiuto!
E non dimenticate poi di esercitarvi!

Analisi conformazionale dell’etano

Fattore che destabilizza il conformero eclissato: tensione torsionale (repulsione tra gli elettroni di legame di due sostituenti)
Fattore che stabilizza il conformeto sfalsato: iperconiugazione.


Analisi conformazionale del butano

In questo caso entra in gioco anche la tensione sterica (repulsione tra le nuvole elettroniche dei sostituenti)

Analisi conformazionale del cicloesano

Per i cicloalcani dobbiamo prendere in considerazione anche la tensione angolare o d’anello (dovuta alla deviazione dell’angolo dall’angolo tetraedrico).
Nel caso del cicloesano a sedia, l’angolo è di 111°, molto vicino all’angolo tetraedrico.

Perchè la conformazione a sedia è più stabile delle altre?

Cicloesani monosostituiti

Cicloesani disostituiti

Fattori che destabilizzano i conformeri a sedia:

-Interazioni 1,3-diassiali

-Altre interazioni gauche


Risorse interattive:

Proiezioni di Newman del butano e dell’etano: seguendo questi link e cliccando sulle proiezioni di Newman è possibile confrontare quelle sfalsate e quelle eclissate, inoltre, cliccando sulle frecce è possibile visualizzare la rotazione intorno al legame sigma.

Conformazioni del butano (rispetto al legame C2-C3): anche qui è possibile interagire come descritto sopra per visualizzare tutte le diverse conformazioni e l’energia ad esse associata.

Conformazioni del cicloeasano (modalità interattiva: cliccare su conformeri e su frecce, come descritto sopra).

Alcune rappresentazioni strutturali dei composti organici: proiezioni di Newman e strutture a cavalletto

Diversi tipi di rappresentazioni strutturali dei composti organici sono disponibili e ciascuna di esse è utile per mettere in evidenza determinati aspetti spaziali (e non solo). Saperle scrivere e leggere è fondamentale. Inoltre, è importante saper convertire queste rappresentazioni tra loro.

Sicuramente una struttura che vedremo spesso è quella a segmenti, in cui l’orientamento nello spazio dei sostituenti viene indicato usando un cuneo pieno (verso l’osservatore) e un cuneo tratteggiato (lontano dall’osservatore). Questo tipo di rappresentazione però non è adatta per l’analisi conformazionale, nè utile per mostrare gli aspetti stereochimici delle reazioni.

Le proiezioni di Newman sono usate per rappresentare su carta le strutture tridimensionali che derivano dalla rotazione intorno ai legami sigma. Indicazioni su come scriverle sono riportate nel paragrafo 3.11 del Bruice. Le strutture a cavalletto mostrano il legame C-C in modo prospettico. In particolare, stiamo osservando la molecola da un angolo. I legami possono essere eclissati o sfalsati.

A questo punto, vVediamo la relazione esistente tra la proiezione a cavalletto e la proiezione di Newman. Se immaginiamo la proiezione di Newman come una rappresentazione 2D della struttura a cavalletto, che invece ci mostra il legame C-C da un certo angolo, il passaggio dall’una all’altra dovrebbe essere immediato.

Per passare dalla proiezione a cavalletto a quella di Newman, immaginiamo di proiettare i legami (e gli atomi) sul foglio; per fare il contrario, immaginiamo di estendere la proiezione di Newman fuori dal foglio.

ESEMPIO:
Nella figura in basso sono riportate la proiezione di Newman e la struttura a cavalletto corrispondenti di una delle conformazioni sfalsate (riquadro giallo) ed eclissate (riquadro verde) del 2-metilpentano, secondo il legame C2-C3.

Una nota a parte è essenziale per le rappresentazioni del cicloesano, che sono ampiamente trattate sul libro. Nel paragrafo 3.13 vedrete come disegnare i conformeri a sedia e come effettuare la conversione d’anello. A pagina 133 sono disponibili invece informazioni su come disegnare la proiezione di Newman del cicloesano.

*In questo post di fa spesso riferimento al libro: in questo caso ci riferiamo all’ultima edizione del Bruice. Chi ha un libro diverso, potrà avvalersi dell’aiuto dell’indice analitico

Tensione torsionale, sterica e angolare

Gli isomeri conformazionali si interconvertono rapidamente l’uno nell’altro, in conseguenza della libera rotazione intorno al legame singolo. In genere, questi isomeri non possono essere separati l’uno dall’altro.

In virtù della rotazione intorno al legame sigma, per uno stesso composto è possibile scrivere diverse conformazioni.

In realtà, questa rotazione intorno al legame singolo non è completamente libera, dato che, nel momento in cui gli elettroni di legame vengono a trovarsi alla minima distanza (nelle conformazioni eclissate) ci sarà una repulsione tra di essi che porterà all’instaurarsi della tensione torsionale. La tensione torsionale è dunque la resistenza opposta alla rotazione dei legami ed è dovuta alla repulsione tra gli elettroni di legame. I conformeri sfalsati sono ulteriormente stabilizzati dall‘iperconiugazione, che vede la sovrapposizione momentanea di un orbitale di legame sigma, occupato da elettroni, e un orbitale di antilegame vuoto di un C-H adiacente. I due orbitali si trovano in una posizione favorevole per la sovrapposizione solo nei conformeri sfalsati.
A seguire, vediamo come questi due fattori determinano le differenze di energia nelle conformazioni dell’etano.

Se ai carboni sono legati dei gruppi più ingombranti dell’idrogeno, dobbiamo tener conto anche della tensione sterica, che è il risultato della repulsione tra le nuvole elettroniche di atomi o gruppi. Segue l’esempio delle conformazioni del butano secondo il legame C2-C3. Gruppi che danno maggiore ingombro sterico, contribuiranno maggiormente alla tensione sterica.

Infine, nel caso dei cicloalcani, è necessario tener presente un terzo tipo di tensione, che è quella angolare (o di anello), che si manifesta quando gli angoli di legame deviano dal valore ideale.

Nel caso del cicloesano, esistono diverse conformazioni caratterizzate da diverse energie. Le due conformazioni più stabili, quelle a sedia, sono prive di tensione angolare, dato che l’angolo di legame è molto vicino a quello tetraedrico, e di tensione torsionale, dato che tutti i legami C-H sono sfalsati. In presenza di sostituenti diversi dall’idrogeno, dobbiamo tener, invece, conto della eventuale tensione sterica. Il conformero a sedia con un sostituente in posizione equatoriale ha meno tensione sterica ed è perciò più stabile del conformero con il sostituente assiale. Un sostituente in posizione assiale ha interazioni 1,3-diassiali sfavorevoli.
In presenza di più sostituenti, dobbiamo valutare la stabilità relativa dei due conformeri a sedia caso per caso.

NB: questi appunti sono utili solo se prima si è studiata la teoria utilizzando il libro di riferimento.

Per informazioni su come scrivere le varie rappresentazioni, vedere https://chimicaorganicadistabif.com/2024/10/18/alcune-rappresentazioni-strutturali-dei-composti-org

Per i cicloesani a sedia e l’inversione dell’anello, vedere https://chimicaorganicadistabif.com/2024/10/18/cicloesano-inversione-di-anello/

Altro materiale utile si trova qui: https://chimicaorganicadistabif.com/2024/10/18/analisi-conformazionale-10/

CdL Scienze Biologiche-Visione PROVA INTERCORSO, PROVA DI RECUPERO e altri avvisi

VISIONE PROVA

a) Gli studenti che hanno superato la prova CON RISERVA (matricole in giallo e arancione) e coloro che NON hanno superato (rosso e nero) potranno prendere visione della prova prenotando il ricevimento SINGOLO seguendo il link dedicato sulla pagina del corso.

b) Gli studenti della prima fascia (verde scuro con scritta bianca) potranno visionare la prova a lezione martedì 28 durante la pausa.

c) Gli studenti della seconda fascia a partire dall’alto potranno visionare la prova a lezione lunedì 27 durante la pausa.

d) Tutti gli altri studenti potranno visionare la prova in concomitanza con la prova di recupero, cioè martedì tra le 16 e le 18. Non è necessaria la prenotazione e seguiranno informazioni sull’aula.

Coloro che appartengono ad uno dei gruppi delle lettere b-d hanno comunque la possibilità di visionare la prova prenotando il ricevimento, qualora lo reputino necessario o qualora non siano disponibili nelle fasce orarie selezionate.


EMAIL Relavite al provvedimento disciplinare

Ho ricevuto diverse mail di persone che mi segnalano un possibile inserimento erroneo nella lista delle persone alle quali si applica il provvedimento. Provvederò a fare i controlli appena sarà possibile, ma non prima della settimana prossima; per cui non riceverete sicuramente risposta prima.

In ogni caso, spero che sia chiaro che più che una punizione il provvedimento è un richiamo alla responsabilità personale e collettiva!


PROVA DI RECUPERO

Gli studenti interessati a sostenere la prova di recupero in data 28/10 alle 16:00 dovranno prenotarsi usando il seguente link: https://forms.cloud.microsoft/e/s81V7Ak4Kk

Possono sostenere la prova sia coloro che non hanno superato la prima prova (OVVIAMENTE sarà necessario recuperare gli argomenti per sostenere la prova), sia coloro che sono stati assenti alla prima per motivi di salute o familiari o per qualsiasi altro motivo.

Le prenotazioni sii chiuderanno domenica alle 18:00

CdL Scienze Biologiche – Risultati Prima Prova Intercorso

Di seguito sono riportati i risultati della prima prova intercorso.


Coloro per i quali la matricola è sottolineata sono gli studenti potenzialmente passibili del provvedimento disciplinare, che sarà definito, insieme alle modalità di applicazione, nel corso della lezione di domani (NB: se qualcuno pensa di essere stato erroneamente inserito in questa lista, può darne comunicazione alla docente, che provvederà ad un controllo ulteriore; inoltre, si rende noto che sarà effettuato a prescindere un ulteriore controllo, per cui se qualcuno non è stato ancora individuato, non è detto che non si trovi nelle condizioni di subire suddetto provvedimento. Nel caso in cui l’inserimento nella lista di coloro che subiscono il provvedimento dovesse essere successivo, riceverete comunicazione via email).


Gli studenti identificati con il colore verde hanno superato la prova con sufficienza (verde scuro voti più alti) e sono ammessi a sostenere la seconda prova intercorso (ovviamente, l’ammissione è subordinata alla frequenza alle lezioni, secondo quanto già chiarito precedentemente).

NB: I BONUS ottenuti dalla vittoria della Weekend Organic Chemistry Challenge (e delle sfide a sorpresa) sono già stati aggiunti nel conteggio del punteggio finale.


Gli studenti identificati dai colori giallo e arancione hanno superato con riserva. Anche gli studenti che hanno superato con riserva sono ammessi a sostenere la seconda prova intercorso.


Per gli studenti indicati dai colori rosso e nero, di seguito riportati, la prova si intende non superata. Questi studenti non sono ammessi a sostenere la seconda prova intercorso.
Il nero indica una insufficienza gravissima (voto minore di 6…e si ricorda che i voti sono espressi in trentesimi e che anche a questi puntieggi sono stati aggiunti eventuali bonus ottenuti con le challenge).

Gli studenti presenti in questa lista, così come quelli assenti per motivi di salute o familiari, potranno sostenere una prova di recupero in data 28/10. I dettagli saranno comunicati successivamente.

Tutti coloro che vorranno prendere visione della prova potranno farlo secondo il calendario che sarà successivamente comunicato dalla docente.

Comunicazione importante per gli studenti del CdL in Scienze Biologiche che hanno sostenuto la prova intercorso in data odierna

Nella giornata odierna, la lezione di Chimica Organica ha registrato il numero più basso di presenze dall’inizio del corso. Tuttavia, la situazione più grave si è verificata durante la lezione di Anatomia Comparata, alla quale hanno partecipato solamente 37 studenti.

Alla luce di quanto stabilito sin dall’inizio del corso, vi informo che è attualmente in fase di valutazione la sospensione delle prove intercorso. L’opportunità di sostenere le prove successive alla prima sarà decisa in base all’andamento delle presenze nelle prossime lezioni di entrambi i corsi.

Nel frattempo, vi comunico che è previsto un provvedimento disciplinare nei confronti di:

  • Tutti gli studenti assenti alla lezione di oggi di Chimica Organica, indipendentemente dall’anno di corso;
  • Gli studenti del secondo anno assenti alla lezione di Anatomia Comparata.

Fanno eccezione esclusivamente coloro che risultano presenti al corso obbligatorio sulla sicurezza (NB: Sono in possesso degli elenchi delle presenze sia di questo corso sia della lezione di Anatomia Comparata).

Il provvedimento sarà comunicato lunedì a lezione e consisterà o nella decurtazione di un minimo di 5 punti dal punteggio della prova intercorso, oppure nella sospensione della validità della prova stessa per gli studenti in questione. Mi riservo la decisione finale dopo aver ascoltato le vostre motivazioni, che potrete presentare in modo maturo e responsabile durante la lezione del 20/10. Desidero chiarire che il provvedimento sarà in ogni caso applicato, indipendentemente dalle ragioni presentate (la decisione da prendere è solo nel merito del provvedimeto specifico).

Le prove intercorso non sono un obbligo del docente, ma rappresentano uno strumento pensato per facilitarvi nello studio. La vostra assenza massiccia dalle lezioni lascia invece intendere che queste prove non stiano contribuendo positivamente al vostro percorso universitario. Se le prove intercorso vengono vissute come una serie di “mini-esami”, allora perde senso mantenerle: sarà più opportuno fare un unico esame finale.

Siete studenti universitari, e in quanto tali non avete l’obbligo formale di frequenza. Tuttavia, ciò non giustifica il comportamento irrispettoso nei confronti del lavoro dei docenti, né l’atteggiamento irresponsabile verso i vostri colleghi e voi stessi.

Vi prego di evitare tentativi inutili di giustificazione e richiesta di intercessioni da parte dei rappresentati degli studenti. Sarò disponibile ad ascoltarvi personalmente lunedì, con l’augurio che il confronto avvenga con spirito costruttivo e consapevole.

Corso di Metabolomica: Prossima lezione e dettagli organizzativi

La prossima lezione di metabolomica si terrà il 20 Ottobre 2025 alle ore 15:00 in aula C1.

Seguiranno lezioni tutti i lunedì con lo stesso orario. Le lezioni teoriche si concluderanno (salvo imprevisti) il 1 dicembre.

Nel corso del mese di dicembre si svolgeranno le attività pratiche: le date e gli orari saranno concordati successivamente.

Approfitto per ricordarvi che in questa settimana si terrà un importante evento presso il nostro dipartimento, cui siete tutti invitati: https://chimicaorganicadistabif.com/2025/10/11/phdays-2025/

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